Dosya:Nucleotides syn1.svg

testwiki sitesinden
Gezinti kısmına atla Arama kısmına atla
Orijinal dosya (SVG dosyası, sözde 1.062 × 958 piksel, dosya boyutu: 129 KB)

Bu dosya Wikimedia Commons deposunda bulunmaktadır ve diğer projeler tarafından kullanılıyor olabilir. Aşağıda dosya açıklama sayfasındaki açıklama gösteriliyor.

Özet

Açıklama
English: The synthesis of IMP. The color scheme is as follows:
 
enzymes
 
coenzymes
 
substrate names
 
metal ions
 
inorganic molecules
Image created using LaTeX and the generated PDF converted to SVG using this.
Tarih
Kaynak Yükleyenin kendi çalışması
Yazar Krishnavedala
SVG gelişimi
InfoField
 Bu SVG kaynak kodu geçerlidir.
 Bu vektörel grafik LaTeX ile oluşturuldu.
Kaynak kodu
InfoField

LaTeX code

Source code
\documentclass[12pt,border=1pt]{standalone}
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage[utf8]{inputenc}
\usepackage{chemfig,chemmacros}
\usepackage{lmodern}
\usetikzlibrary{decorations.pathmorphing}

\chemsetup[chemformula]{font-shape=sf,format=\sffamily}
\renewcommand*{\familydefault}{\sfdefault}
\renewcommand*\printatom[1]{\ensuremath{\mathsf{#1} } }
\setatomsep{2.5em}
\setdoublesep{.6ex}
\setarrowdefault{,2,thick}
\setbondstyle{thick}

\makeatletter
% From: http://tex.stackexchange.com/a/125761
% Initial arguments:
% #1, #2: Same as for -U> (above arrow)
% #3: Additional label at midpoint (also above arrow)
% #4, #5, #6: Like #1, #2, and #3, but below arrow
\definearrow9{-X>}{%
    \CF@arrow@shift@nodes{#7}%
    \expandafter\draw\expandafter[\CF@arrow@current@style,-CF@full](\CF@arrow@start@node)--(\CF@arrow@end@node)node[midway](Xarrow@arctangent){};%
    \edef\CF@tmp@str{\ifx\@empty#1\@empty[draw=none]\fi}%
    \expandafter\draw\CF@tmp@str (Xarrow@arctangent)%
        arc[radius=\CF@compound@sep*\CF@current@arrow@length*\ifx\@empty#8\@empty0.333\else#8\fi,start angle=\CF@arrow@current@angle-90,%
        delta angle=-\ifx\@empty#9\@empty60\else#9\fi]node(Xarrow1@start){};
    \edef\CF@tmp@str{[\ifx\@empty#2\@empty draw=none,\fi-CF@full]}%
    \expandafter\draw\CF@tmp@str (Xarrow@arctangent)%
        arc[radius=\CF@compound@sep*\CF@current@arrow@length*\ifx\@empty#8\@empty0.333\else#8\fi,start angle=\CF@arrow@current@angle-90,%
        delta angle=\ifx\@empty#9\@empty60\else#9\fi]node(Xarrow1@end){};
    \edef\CF@tmp@str{\ifx\@empty#4\@empty[draw=none]\fi}%
    \expandafter\draw\CF@tmp@str (Xarrow@arctangent)%
        arc[radius=\CF@compound@sep*\CF@current@arrow@length*\ifx\@empty#8\@empty0.333\else#8\fi,start angle=\CF@arrow@current@angle+90,%
        delta angle=\ifx\@empty#9\@empty60\else#9\fi]node(Xarrow2@start){};
    \edef\CF@tmp@str{[\ifx\@empty#5\@empty draw=none,\fi-CF@full]}%
    \expandafter\draw\CF@tmp@str (Xarrow@arctangent)%
        arc[radius=\CF@compound@sep*\CF@current@arrow@length*\ifx\@empty#8\@empty0.333\else#8\fi,start angle=\CF@arrow@current@angle+90,%
        delta angle=-\ifx\@empty#9\@empty60\else#9\fi]node(Xarrow2@end){};
    \edef\CF@tmp@str{\if\string-\expandafter\@car\detokenize{#7.}\@nil-\else+\fi}%
    \CF@arrow@display@label{#1}{0}\CF@tmp@str{Xarrow1@start}{#2}{1}\CF@tmp@str{Xarrow1@end}%
    \CF@arrow@display@label{#3}{0.5}\CF@tmp@str\CF@arrow@start@node{}{}{}\CF@arrow@end@node%
    \edef\CF@tmp@str{\if\string-\expandafter\@car\detokenize{#7.}\@nil+\else-\fi}%
    \CF@arrow@display@label{#4}{0}\CF@tmp@str{Xarrow2@start}{#5}{1}\CF@tmp@str{Xarrow2@end}%
    \CF@arrow@display@label{#6}{0.5}\CF@tmp@str\CF@arrow@start@node{}{}{}\CF@arrow@end@node%
}
\makeatother

\begin{document}
\definesubmol\nobond{-[,0.2,,,draw=none]}
\definesubmol{rb}{Ribotide}
\schemestart[][west]
	\chemname{\chemfig{ {\color{red}P}-O--[:-18]*5(-(<:HO)-(<:OH)-(<:OH)-O-) } }{\color{brown}R5P}
    \arrow{-X>[{\color{orange}ATP}][{\color{orange}AMP}][{\color{magenta}\ch{Mg^2+} }][][][\color{blue}PRPS1]}
	\chemname{\chemfig{ {\color{red}P}-O--[:-18]*5(-(<:HO)-(<:OH)-(<:O-[0]{\color{red}P}-[0,,,,red,decorate,decoration=snake, segment length=6pt]{ {\color{red}P} })-O-) } }{\color{brown}PRPP}
    \arrow{-X>[{\color{orange}Gln},{\color{red}\ch{H2O} }][{\color{brown}Glu},{\color{red}2\ch{P_i} }][{\color{magenta}\ch{Mg^2+} }][][][\parbox{5em}{\centering\color{blue}PPAT\\1}]}
    \chemname{\chemfig{ {\color{red}P}-O--[:-18]*5(-(<:HO)-(<:OH)-(<NH_2)-O-) } }{\color{brown}5-PRA}
    \arrow(.-45--){-X>[*0{ {\color{orange}ATP},{\color{brown}Gly} }][*0{ {\color{orange}ADP},{\color{red}\ch{P_i} } }][*0{\color{magenta}\ch{Mg^2+} }][][][*0\parbox{5em}{\centering\color{blue}GART (E1)\\2}]}[-90,1.5]
    \chemname*{\chemfig{O=[:30](-[2]-[::-60]NH_2)-[:-30]NH-[6,,1]!{rb} } }{\color{brown}GAR}
    \arrow{-X>[][][\parbox{5em}{\centering\color{blue}GART (E2)\\3}][\parbox{2.75cm}{ {\color{orange}\ch{N^{10} }-formyl-THF} }][{\color{orange}THF}][][-2em]}[180,3]
    \chemname*{\chemfig{ O=[:30] *6(-NH(-[6]!{rb})-[,,,,draw=none]O=-NH--) } }{\color{brown}FGAR}
    \arrow{-X>[][][\parbox{5em}{\centering\color{blue}PFAS\\4}][{\color{orange}Gln},{\color{orange}ATP},{\color{red}\ch{H2O} }][{\color{brown}Glu},{\color{orange}ADP},{\color{red}\ch{P_i} }][{\color{magenta}\ch{Mg^2+} }][-2em]}[180,2.5]
    \chemname*{\chemfig{ HN=[:30] *6(-NH(-[6]!{rb})-[,,,,draw=none]O=-NH--) } }{\color{brown}FGAM}
    \arrow{-X>[][][\parbox{5em}{\centering\color{blue}GART (E3)\\5}][{\color{orange}ATP}][{\color{orange}ADP},{\color{red}\ch{P_i} }][{\color{magenta}\ch{Mg^2+} }][-2em]}[180]
    \chemname*{\chemfig{*5((-H_2N)-N(-!{rb})-=N-=)} }{\color{brown}AIR}
    \arrow{-X>[*0{ {\color{orange}ATP},{\color{red}\ch{HCO3^-} } }][*0{ {\color{orange}ADP},{\color{red}\ch{P_i} } }][*0{\color{magenta}\ch{Mg^2+} }][][][*0\parbox{5em}{\centering\color{blue}PAICS (E1)\\6}]}[-90]
    \chemname*{\chemfig{*5((-HN_2)-N(-!{rb}) -=N- (-[:150](=[::-60]O)-[::60]OH) =)} }{\color{brown}CAIR}
    \arrow{-X>[{\color{orange}ATP},{\color{brown}ASP}][{\color{orange}ADP},{\color{red}\ch{P_i} }][{\color{magenta}\ch{Mg^2+} }][][][\parbox{5em}{\centering\color{blue}PAICS (E2)\\7}]}
    \chemname*{\chemfig{ O=[:30] *6(-O^{-} -[,,,,draw=none]-[,,,,draw=none]\chembelow{N}{H} (-[:30](=[2]O)-[:-36]*5(=(-H_2N)-N(-!{rb})-=N-))
    	- (-(=[::60]O)-[::-60]O^{-}) --) } }{\color{brown}SACAIR}
    \arrow{-X>[][{\color{brown}Fumarate}][][][][\parbox{5em}{\centering\color{blue}ADSL\\8}]}\quad
    \chemname*{\chemfig{*5((-HN_2)-N(-!{rb}) -=N- (-[:120](=[::-60]O)-[::60]NH_2) =)} }{\color{brown}AICAR}
    \arrow(.-50--){-X>[*0\parbox{2.75cm}{ {\color{orange}\ch{N^{10} }-formyl-THF} }][*0{ {\color{orange}THF} } ][][][][*0\parbox{5em}{\centering\color{blue}ATIC (E1)\\9}]}[-90,1.5]
    \chemname*{\chemfig{*5((-HN-[::-60]=[::60]O)-N(-!{rb}) -=N- (-[:150](=[::-60]O)-[::60]NH_2) =)} }{\color{brown}FAICAR}
    \arrow{-X>[][][\parbox{5em}{\centering\color{blue}ATIC (E2)\\10}][][{\color{red}\ch{H2O} }][][-2em]}[180,2.5]
    \chemname*{\chemfig{ *6(=N- (*5(-N(-!{rb})-=N-=)) --(=O) -[,,,2]HN-[,,2]=) } }{\color{brown}IMP}
\schemestop
\end{document}

Lisanslama

Ben, bu işin telif sahibi, burada işi aşağıdaki lisans altında yayımlıyorum:
Creative Commons CC-Zero Bu dosya Creative Commons CC0 1.0 Evrensel Kamu Malı Adanması altında kullanıma sunulmuştur.
Bu çalışmayı oluşturan kişi bu senet ile eser hakkında tüm dünya çapında telif hakkı yasaları kapsamında, yasalar tarafından izin verilen ölçülerde ve diğer benzer tüm haklarından feragat etmiş ve kamu malı olarak nitelendirmiştir. Siz bu çalışmayı ve eseri hiç bir izin almadan ticari amaçlar da dahil olmak üzere kopyalayabilir, değiştirebilir ve serbestçe dağıtabilirsiniz.

Altyazılar

Bu dosyanın temsil ettiği şeyin tek satırlık açıklamasını ekleyin.

Bu dosyada gösterilen öğeler

betimlenen

6 Ağustos 2014

132.563 bayt

958 piksel

1.062 piksel

image/svg+xml

6bb00e7cb09fc420853583e7f62b47d15ff408ca

Dosya geçmişi

Dosyanın herhangi bir zamandaki hâli için ilgili tarih/saat kısmına tıklayın.

Tarih/SaatKüçük resimBoyutlarKullanıcıYorum
güncel20.48, 6 Ağustos 201420.48, 6 Ağustos 2014 tarihindeki sürümün küçültülmüş hâli1.062 × 958 (129 KB)wikimediacommons>Krishnavedala{{Information |Description ={{en|1=The synthesis of IMP. The color scheme is as follows: <span style="font-weight: bold;"><span style="color: blue;">enzymes</span>, <span style="color: orange">coenzymes</span>, <span style="color: brown;">substrate...

Aşağıdaki sayfa bu dosyayı kullanmaktadır: